醫用污水臭氧發生器主要用于消毒滅菌。用臭氧發生器對醫院污水進行消毒處理，可以切斷傳染源，解除后顧之憂。而且臭氧可以在幾分鐘內殺死所有病毒，比等效氯快200~3000倍。

許多人認為污水處理廠大型臭氧發生器設備的使用是一項非常昂貴的費用，其實這種觀點是錯誤的。這種設備使用方便，不需要復雜的操作和人工操作，可以為雇主節省工資和成本，且臭氧發生器的能耗相對較小。

工業廢水處理用臭氧發生器采用電暈放電技術，工業、生活、醫院廢水中產生的臭氧幾乎全部用于工業生產，產生的臭氧可用于烷基苯磺酸鈉、焦油、COD、BOD、污泥、氨氮等含污染物廢水的初步處理。